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新華社上海9月22日電(記者吳振東)記者從上海海洋大學獲悉,由該校科研團隊牽頭的中華絨螯蟹基因組與斷肢再生研究取得突破,相關成果近日發(fā)表于國際學術期刊《科學進展》。
中華絨螯蟹俗名大閘蟹,是我國高經(jīng)濟價值的水產(chǎn)甲殼動物,產(chǎn)業(yè)規(guī)模龐大。科研人員介紹,斷肢現(xiàn)象在中華絨螯蟹養(yǎng)殖過程中較為普遍,盡管這一蟹種具有斷肢再生能力,但再生的肢體與正常生長的相比有顯著差異,斷肢再生后的成蟹大多售價低廉,給養(yǎng)殖者造成損失。因此,揭開中華絨螯蟹斷肢再生的基因秘密,對其科學育種、優(yōu)化養(yǎng)殖技術等均有重要意義。
中華絨螯蟹染色體數(shù)目多、基因組重復序列高,長期以來存在基因組組裝難題,而這又是下一階段研究工作的基礎。上海海洋大學科研團隊聯(lián)合中外研究人員,利用第三代測序、高通量染色體構象捕獲等技術,進行了長江水系中華絨螯蟹的全基因組測序和組裝,最終獲得染色體水平的精細基因組圖譜,共鑒定出20286個蛋白編碼基因。
在此基礎上,科研人員進行比較基因組學分析,通過對斷肢再生不同發(fā)育時期的比較轉錄組和基因共表達分析發(fā)現(xiàn),Innexin基因家族在中華絨螯蟹斷肢再生的早期發(fā)揮了重要的分子信號傳導作用,其中Innexin2基因通過引導下游基因發(fā)揮作用,介導了中華絨螯蟹的斷肢再生過程。
研究還發(fā)現(xiàn),在中華絨螯蟹變態(tài)、再生的生物學過程中,SMYDA基因家族發(fā)揮著重要的表觀修飾作用。
據(jù)介紹,我國水產(chǎn)養(yǎng)殖已從傳統(tǒng)的表型育種發(fā)展到分子育種,該研究為中華絨螯蟹的分子育種提供了重要的基因組資源和平臺?!耙环矫?,通過后續(xù)品種改良,減少斷肢現(xiàn)象的發(fā)生;另一方面可以幫助提升中華絨螯蟹養(yǎng)殖技術,使養(yǎng)殖者在面對斷肢現(xiàn)象時采取更及時、科學的干預?!鄙虾:Q蟠髮W科研團隊負責人王成輝教授說。
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